Залы музея: Зал 1 История России от Рюрика до Императора Александра III. 
Родословная таблица Домов Рюрика и Романовых, уникальные книги и монеты, портреты представителей Державного Дома Романовых, Указ с личной подписью Императора АлександраIII, подлинное «Евангелие» Иоанна Кронштадтского.  
Зал 2 Период правления Императора Николая II. 
Уникальные Коронационные книги, подлинные фотографии из архива Царской Семьи, икона Божией Матери «Феодоровской» из покоев Императрицы, медали, ордена, монеты, фарфоровые изделия и предметы быта конца XIX - начала XX веков.  
Зал 3 Период революционной смуты 1917 года. 
Газеты, книги, официальные документы, воспоминания очевидцев, механический календарь из Ливадийского дворца. Зал 4 Арест, ссылка и расстрел Царской Семьи. 
Уникальные материалы по личности Григория Ефимовича Распутина, фотографии и воспоминания об аресте и ссылке Царской Семьи, книга следователя Н.Соколова «Убийство Царской Семьи».  
Стенд, посвященный основателю Музея – отцу Василию. 
Коридор. Дополнительные материалы. 
В экспозиции музея представлены материалы по истории царствования Державного Дома Романовых, основная часть музейной коллекции посвящена Святому Страстотерпцу Царю-Мученику Николаю и членам его семьи. Цель экспозиции - донести до наших современников историческую правду о царствовании Дома Романовых и, особенно, о жизни и смерти семьи последнего Российского Императора. Коллекция музея постоянно пополняется новыми экспонатами и документами, накапливаются материалы об исповедническом пути Российского Императорского Дома в изгнании. В собрании музея имеются уникальные экспонаты: - Рукописные книги XV - XVI веков в кожаных переплетах.
- Родословная династии Романовых.
- Серебряные монеты царской чеканки, включая редкую с профилем Петра III.
- Подлинное письмо, написанное рукой Александра II.
- Ордена и медали XVIII – XIX веков.
- Подлинное «Евангелие», принадлежавшее Иоанну Кронштадтскому.
- Икона Божией Матери «Феодоровской» из покоев Императрицы.
- Подлинные фотографии, сделанные членами Императорской семьи.
- «Дело Тобольской Духовной Консистории. О Григории Распутине-Новых».
- Подлинное «Евангелие», принадлежавшее Великой Княгине Елизавете Феодоровне (родной сестре Императрицы).
- Предметы быта и памятные медали XIX века.
- Собрание аудио- и видеоматериалов. Основную часть коллекции собирал в течение 50-лет протоиерей Василий Фонченков, профессор Иоанно-Богословского университета. | 
